卵巢妊娠囊對于女性的危害還是非常大的，因此大家要及時的進行治療，現階段關于卵巢妊娠囊的治療方式也是有很多的，而且效果是比較好的。

卵巢妊娠囊的治療主要是手術，手術中應保留卵巢組織。根據病變的大小，可以進行卵巢妊娠囊病變切除，卵巢楔形切除或部分卵巢切除術。如果卵巢破壞嚴重，可行的附件切除術一般不主張單純的卵巢切除術并保留輸卵管的同一側，這可能導致懷孕的卵子游到外面，輸卵管妊娠的發生增加了切除下面的機會方法。

1、全部切除卵巢：若出血，同側卵巢破壞嚴重，對側正常，剖腹手術常做同側卵巢切除術。

2、卵巢楔形切除術：如果出血不多，當探查性剖腹探查病灶僅涉及部分卵巢時，可做楔形切除病變，其余卵巢術后監測血β-HCG水平，如減慢，表明可能仍然有一些絨毛組織殘留物可以用MTX治療。

3、藥物治療：對于尚未破裂的卵巢妊娠囊的術前診斷，B細胞介導的胚胎殺傷藥物注射可用于保守治療。